AT4G21180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DnaJ / Sec63 Brl domains-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
J domain protein localized in ER membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATERDJ2B; FUNCTIONS IN: unfolded protein binding, heat shock protein binding; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: integral to endoplasmic reticulum membrane, endoplasmic reticulum, plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), Sec63 domain (InterPro:IPR004179), Sec63 domain, subgroup (InterPro:IPR018127), Heat shock protein DnaJ, N-terminal (InterPro:IPR001623), Heat shock protein DnaJ (InterPro:IPR003095); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DnaJ / Sec63 Brl domains-containing protein (TAIR:AT1G79940.3); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11289337..11292179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74828.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 661 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAESEENSVL FPIFILTMMA IPLVPYTFVK LSRAFSKKQR SIHCQCLECD RSGKYKRSIS QSISSFTSCS NLTVVLLWIV MIFLIYHTKN MSRESQLFEP 101: FGILGLEPGA SDSEIKKAYR RLSIQYHPDK NPDPEANKYF VESIAKAYQA LTDPLSRENF EKYGHPDGRQ GYTMGIALPQ FILNMNGESG GILLLCTVGL 201: CILLPLVIAS IYLWRSSKYT GNHVKLQTRQ AYFELLQPSL TPSKVMDIFI RAAEYAEISV RKSDDESLQK LFMSVKSELN LDPKKLKQEE AKFWKKHPAT 301: IKTELLIQKQ LTRESSVLSP TLQRDFRHVL EFAPRLLEDL IKMAVIPRNE QGRGWLRPAL GVMELSQCIV QAVPLSARKS SSEDIAPFLQ LPHFNESIAK 401: SIALQVKSFQ KFQELSLAER SKLLREVVSL SETDVQDIEK VLEMIPSLKI NVTCKTEGEE GIQEGDIMTV QAWITLKRPN GLIGAIPHSP YFPFHKEENF 501: WVLLADSNHV WFFQKVKFMD EAGAIAAASN TITETMEPLG ASVKETNDAV KEAVEKVKSG SRLVMGRLLA PGEGTYNLTC FCLSDTWIGC DQKTSLKVEV 601: LKRTRDVEGE NAEEGLEEED DEIEEEDYES EYSEDEEDKK RGSKKKVNKE SSSEESGSDE E |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)