AT4G17050.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : ureidoglycine aminohydrolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with ureidoglycine aminohydrolase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ureidoglycine aminohydrolase (UGLYAH); FUNCTIONS IN: ureidoglycine aminohydrolase activity, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: allantoin catabolic process, regulation of transcription; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cupin 2, conserved barrel (InterPro:IPR013096), Cupin, RmlC-type (InterPro:IPR011051), RmlC-like jelly roll fold (InterPro:IPR014710); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:9589662..9592413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33675.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 298 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRSLYLIVFI VISLVKASKS DDGFCSAPSI VESDEKTNPI YWKATNPTLS PSHLQDLPGF TRSVYKRDHA LITPESHVYS PLPDWTNTLG AYLITPATGS 101: HFVMYLAKMK EMSSSGLPPQ DIERLIFVVE GAVTLTNTSS SSKKLTVDSY AYLPPNFHHS LDCVESATLV VFERRYEYLG SHTTELIVGS TDKQPLLETP 201: GEVFELRKLL PMSVAYDFNI HTMDFQPGEF LNVKEVHYNQ HGLLLLEGQG IYRLGDNWYP VQAGDVIWMA PFVPQWYAAL GKTRSRYLLY KDVNRNPL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)