AT4G16480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.969 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : inositol transporter 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a high affinity H+:<i>myo</i>-inositol symporter. The only other compound shown to be transported was pinitol, a methylated derivative of <i>myo</i>-inositol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
inositol transporter 4 (INT4); FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, myo-inositol:hydrogen symporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nositol transporter 3 (TAIR:AT2G35740.1); Has 51354 Blast hits to 41404 proteins in 2520 species: Archae - 707; Bacteria - 26083; Metazoa - 6832; Fungi - 11387; Plants - 4246; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 2097 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:9291246..9293083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62895.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 582 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVEGGIAKAD KTEFTECWRT TWKTPYIMRL ALSAGIGGLL FGYDTGVISG ALLFIKEDFD EVDKKTWLQS TIVSMAVAGA IVGAAVGGWI NDKFGRRMSI 101: LIADVLFLIG AIVMAFAPAP WVIIVGRIFV GFGVGMASMT SPLYISEASP ARIRGALVST NGLLITGGQF FSYLINLAFV HTPGTWRWML GVAGVPAIVQ 201: FVLMLSLPES PRWLYRKDRI AESRAILERI YPADEVEAEM EALKLSVEAE KADEAIIGDS FSAKLKGAFG NPVVRRGLAA GITVQVAQQF VGINTVMYYS 301: PSIVQFAGYA SNKTAMALSL ITSGLNALGS IVSMMFVDRY GRRKLMIISM FGIIACLIIL ATVFSQAAIH APKIDAFESR TFAPNATCSA YAPLAAENAP 401: PSRWNCMKCL RSECGFCASG VQPYAPGACV VLSDDMKATC SSRGRTFFKD GCPSKFGFLA IVFLGLYIVV YAPGMGTVPW IVNSEIYPLR YRGLGGGIAA 501: VSNWVSNLIV SESFLSLTHA LGSSGTFLLF AGFSTIGLFF IWLLVPETKG LQFEEVEKLL EVGFKPSLLR RREKKGKEVD AA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)