AT4G15280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.574 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 71B5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 71B5 (UGT71B5); FUNCTIONS IN: quercetin 3-O-glucosyltransferase activity, UDP-glycosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT4G15260.1); Has 7674 Blast hits to 7626 proteins in 477 species: Archae - 0; Bacteria - 573; Metazoa - 2069; Fungi - 31; Plants - 4920; Viruses - 24; Other Eukaryotes - 57 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:8719182..8720618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53716.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 478 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKIELVFIPL PGIGHLRPTV KLAKQLIGSE NRLSITIIII PSRFDAGDAS ACIASLTTLS QDDRLHYESI SVAKQPPTSD PDPVPAQVYI EKQKTKVRDA 101: VAARIVDPTR KLAGFVVDMF CSSMIDVANE FGVPCYMVYT SNATFLGTML HVQQMYDQKK YDVSELENSV TELEFPSLTR PYPVKCLPHI LTSKEWLPLS 201: LAQARCFRKM KGILVNTVAE LEPHALKMFN INGDDLPQVY PVGPVLHLEN GNDDDEKQSE ILRWLDEQPS KSVVFLCFGS LGGFTEEQTR ETAVALDRSG 301: QRFLWCLRHA SPNIKTDRPR DYTNLEEVLP EGFLERTLDR GKVIGWAPQV AVLEKPAIGG FVTHCGWNSI LESLWFGVPM VTWPLYAEQK VNAFEMVEEL 401: GLAVEIRKYL KGDLFAGEME TVTAEDIERA IRRVMEQDSD VRNNVKEMAE KCHFALMDGG SSKAALEKFI QDVIENMD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)