AT4G14680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ATP sulfurylase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
APS3; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Pseudouridine synthase/archaeosine transglycosylase-like (InterPro:IPR015947), Sulphate adenylyltransferase (InterPro:IPR002650); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP sulfurylase 1 (TAIR:AT3G22890.1); Has 2059 Blast hits to 2056 proteins in 649 species: Archae - 98; Bacteria - 865; Metazoa - 242; Fungi - 201; Plants - 189; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 464 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8413443..8415311 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52032.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASMSTVFPK PTSFISQPLT KSHKSDSVTT SISFPSNSKT RSLRTISVRA GLIEPDGGKL VDLVVPEPRR REKKHEAADL PRVRLTAIDL QWMHVLSEGW 101: ASPLRGFMRE SEFLQTLHFN LLNLDDGSVV NMSVPIVLAI DDQQKALIGE SKRVSLVDSD DNPIAILNDI EIYKHPKEER IARTWGTTAP GLPYVEEAIT 201: NAGDWLIGGD LEVLEPVKYN DGLDRFRLSP FELRKELEKR GADAVFAFQL RNPVHNGHAL LMTDTRRRLL EMGYKNPILL LHPLGGFTKA DDVPLSWRMK 301: QHEKVLEDGV LDPETTVVSI FPSPMLYAGP TEVQWHAKAR INAGANFYIV GRDPAGMGHP VEKRDLYDAD HGKKVLSMAP GLERLNILPF RVAAYDKTQG 401: KMAFFDPSRA QDFLFISGTK MRALAKNREN PPDGFMCPGG WKVLVDYYDS LTLTGNTKLP EKIPV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)