AT4G13170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L13 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L13 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, cytosolic large ribosomal subunit, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L13 (InterPro:IPR005822), Ribosomal protein L13, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005755); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L13 family protein (TAIR:AT5G48760.2); Has 1983 Blast hits to 1983 proteins in 630 species: Archae - 297; Bacteria - 430; Metazoa - 343; Fungi - 199; Plants - 322; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 392 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:7655133..7656542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23630.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 206 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSGSGICAK RVVVDGRHHM LGRLASNTAK ELLNGQEVVV VRCEEICLSG GLVRQKMKYM RFLRKRMNTK PSHGPIHFRA PSKIFWRTVR GMIPHKTKRG 101: AAALARLKVF EGIPPPYDKI KRMVIPDALK VLRLQSGHKY CLLGRLSSEV GWNHYDTIKE LETKRKERSQ VMYERKKQLN KLRTKAEKVA EERLGSQLDV 201: LAPVKY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)