AT4G12290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.859 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Copper amine oxidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Copper amine oxidase family protein; FUNCTIONS IN: quinone binding, primary amine oxidase activity, copper ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, amine metabolic process; LOCATED IN: vacuole; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Copper amine oxidase, N-terminal (InterPro:IPR016182), Copper amine oxidase, N2-terminal (InterPro:IPR015800), Copper amine oxidase, N2/N3-terminal (InterPro:IPR015801), Copper amine oxidase, N3-terminal (InterPro:IPR015802), Copper amine oxidase (InterPro:IPR000269), Copper amine oxidase, C-terminal (InterPro:IPR015798); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Copper amine oxidase family protein (TAIR:AT1G62810.1); Has 1550 Blast hits to 1547 proteins in 275 species: Archae - 14; Bacteria - 376; Metazoa - 251; Fungi - 449; Plants - 243; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 217 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7304434..7306973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83237.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 741 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQKSFFRLI FLIVTAGFII SFTSTNFPHA PTRLLDCTDS SSSPLCASRN FLFNKQQPRP IPKHDPKPNT KNHDHVSDTP NHPLDPLTVS EINKIRSILS 101: SHALFTSGTP HALHTVVLEE PEKNLVRHWE KGNPLPPRKA SVIARVGADT HVLTVDISTG RVDSENSPVR VSGYPMMTIE EMNDITVVPF SNADFNRTII 201: SRGVNLTDVI CFPISCGWFG NKEENARVIK SQCFMTQGTP NFYMRPIEGL TILIDLDTKQ VIEITDTGRA IPIPGSTNTD YRFQKLATTD KTRPLNPISI 301: EQPRGPSFVI EDNHLVKWAN WEFHLKPDPR AGVVISRVRV HDPDTHETRD VMYKGFVSEL FVPYMDPSDA WYFKTYMDAG EYGFGLQAMP LVPLNDCPRN 401: AAYMDGVFAA ADGTPFVREN MVCIFESYAG DIGWRHSESP ITGIPIREVR PKVTLVVRMA ASVGNYDYII DYEFQTDGLI KAKVGLSGIL MVKGTTYQNK 501: NQVEKDKDGN EEELHGTLLS ENVIGVIHDH YVTFYLDLDV DGPDNSFVKV NLKRQETEPG ESPRKSYLKA VRNIAKTEKD GQIKLSLYDP SEFHVINSGK 601: TTRVGNPTGY KVVPRTTAAS LLDHDDPPQK RGAFTNNQIW VTPYNKSEQW AGGLFTYQSH GDDTLAVWSD RDRDIENKDI VVWYTLGFHH IPCQEDFPIM 701: PTVSSSFDLK PVNFFERNPI LSAAPNFEHD LPVCGVQSVS A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)