AT4G06676.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.662 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Etoposide-induced 2.4 (InterPro:IPR009890); Has 264 Blast hits to 262 proteins in 100 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 130; Fungi - 16; Plants - 79; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 39 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:3898998..3901589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36209.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 320 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRSKSKQVLL LWLEGFREAC SLHRVVILCL RSRKLLLRTG QCFLLNGLIF LGSLGVFKWF IDPSLQWILP DQCSPLTSQE FCSYGGFYAF LRGGLLQLFY 101: VFWFYPLYML SFILSNIWYN DIAKHGFEAI EISDLNSAEA LRQGEALASL NMANAERPSG LGGVMIGIGE QVYSILLLTF FFLEVCVVGV IPYIGKILNF 201: LLLSWMYAYY CYEYKWNFSG ISLKKRLDFF QSNWAFFAGF GSPCVLAIFF LSPLVSGALM AILFPLFVLT ATGSGPEKLI GAPRRTWKCA GLGKLPIFYI 301: ADTLSMLALS IFRLESPHEN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)