AT4G01950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.547 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of a family of proteins with glycerol-3-phosphate acyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 (GPAT3); FUNCTIONS IN: acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: 14 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycerol-3-phosphate acyltransferase 2 (TAIR:AT1G02390.1); Has 384 Blast hits to 371 proteins in 23 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 11; Fungi - 0; Plants - 371; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:844597..846710 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58765.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 520 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAKISIFQA LVFLFYRFIL RRYRNSKPKY QNGPSSLLQS DLSRHTLIFN VEGALLKSDS LFPYFMLVAF EAGGVIRSFL LFILYPLISL MSHEMGVKVM 101: VMVSFFGIKK EGFRAGRAVL PKYFLEDVGL EMFEVLKRGG KKIGVSDDLP QVMIEGFLRD YLEIDVVVGR EMKVVGGYYL GIMEDKTKHD LVFDELVRKE 201: RLNTGRVIGI TSFNTSLHRY LFSQFCQEIY FVKKSDKRSW QTLPRSQYPK PLIFHDGRLA IKPTLMNTLV LFMWGPFAAA AAAARLFVSL CIPYSLSIPI 301: LAFSGCRLTV TNDYVSSQKQ KPSQRKGCLF VCNHRTLLDP LYVAFALRKK NIKTVTYSLS RVSEILAPIK TVRLTRDRVS DGQAMEKLLT EGDLVVCPEG 401: TTCREPYLLR FSPLFTEVSD VIVPVAVTVH VTFFYGTTAS GLKALDPLFF LLDPYPTYTI QFLDPVSGAT CQDPDGKLKF EVANNVQSDI GKALDFECTS 501: LTRKDKYLIL AGNNGVVKKN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)