AT4G01250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY family transcription factor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY22; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY family transcription factor (TAIR:AT4G23550.1); Has 3274 Blast hits to 2836 proteins in 187 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 3; Plants - 3256; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:522839..524129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32257.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 298 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADDWDLHAV VRGCSAVSSS ATTTVYSPGV SSHTNPIFTV GRQSNAVSFG EIRDLYTPFT QESVVSSFSC INYPEEPRKP QNQKRPLSLS ASSGSVTSKP 101: SGSNTSRSKR RKIQHKKVCH VAAEALNSDV WAWRKYGQKP IKGSPYPRGY YRCSTSKGCL ARKQVERNRS DPKMFIVTYT AEHNHPAPTH RNSLAGSTRQ 201: KPSDQQTSKS PTTTIATYSS SPVTSADEFV LPVEDHLAVG DLDGEEDLLS LSDTVVSDDF FDGLEEFAAG DSFSGNSAPA SFDLSWVVNS AATTTGGI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)