AT4G00310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.969 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Putative membrane lipoprotein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
EMBRYO SAC DEVELOPMENT ARREST 8 (EDA8); Has 49 Blast hits to 49 proteins in 16 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3; Fungi - 8; Plants - 36; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:133857..135235 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33188.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 302 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRIRKNTKLS SVLLSTAGCG GERPDTYVCH LNQSPWDVIP VSSSGDCELT NLVDSSWFLP LSSSSSSSSP PLIHKFIGEE DSFNGNVSLG DCNDTAQRFN 101: SSVSSNQSLV SVEKLNLNAA EEDKYAISPE VEDPMDQSDD YDKKSEALEP NSPVKTSGDD EKVVVTIPTA PKRGRPRGSG KKVSAPALKN PYEFYYYSGF 201: GPRWGRKRGG SDDEKMVIND SKKSRSSASS SSDEDGHKTA AFGGGSVSFD EFDFVDEDYD VMEQDQGSDH GRKKKNEKMI MMKKTMKKGR KPVKERSLKS 301: LM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)