AT3G63170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Chalcone-flavanone isomerase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Chalcone-flavanone isomerase family protein; FUNCTIONS IN: intramolecular lyase activity; INVOLVED IN: cellular amino acid derivative biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast, plastid, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chalcone isomerase, subgroup (InterPro:IPR003466), Chalcone isomerase (InterPro:IPR016087); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Chalcone-flavanone isomerase family protein (TAIR:AT2G26310.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:23334675..23335993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30396.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 279 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSFRFPFSF SQPPRATTSF SGFSISAVAV SVTVGAAAAG AAIAASRNPS HPILEWAFSS HRSSLSPWGS ITLADESVVE PKTGFSFPAS IGDSRRLLGV 101: GLRKKSLLGL KNIDVYAFGV YADCDDVKKL VGDKYANLPA SEIRGNKSFM DDLMEADIKM TIRLQIVYGK LNIRSVRNAF QESVGNRLKK FGGSDNDELL 201: QSFTSLFKDE YKIPRNSTID LTKDPGHVLS VAIEGNHVGS VKSHLLCRSI LDLYIGEEPF DKNAREDFLD NAASLAFDN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)