AT3G57550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : guanylate kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
guanylate kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
guanylate kinase (AGK2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Guanylate kinase (InterPro:IPR008144), Guanylate kinase/L-type calcium channel (InterPro:IPR008145), Guanylate kinase, conserved site (InterPro:IPR020590), Guanylate kinase, sub-group (InterPro:IPR017665); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: guanylate kinase 1 (TAIR:AT2G41880.1); Has 9901 Blast hits to 9873 proteins in 2764 species: Archae - 0; Bacteria - 5418; Metazoa - 1587; Fungi - 182; Plants - 205; Viruses - 105; Other Eukaryotes - 2404 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:21307269..21309193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42555.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 389 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEAPAFFVD HLENGYTNGF GVKSEPKNRD TSVLIGDRSF VIGGNHEGNP LFLGVQIHDK VTNKWSSPSV LGTGPKPCKG YSAIVLPKGR ILVIKKGSAS 101: DDSIWFLEVD TPFIREQKKL LGREVVAWSK GVRGNAEKPI VISGPSGVGK GTLISMLMKE FPSMFGFSVS HTTRAPRCME KNGVHYHFTD KTVMEKEIKD 201: GKFLEFASVH GNLYGTSIES VEVVTDSGKR CILDIDVQGA RSVKASSLDA IFIFVCPPSM KELEDRLRAR GTETEEQIQK RLRNADAEIK AGKSSGIFEH 301: KLYNDNLEEC YKTLKNLLGI NDLAPVNGVE VEGINLPKEH TVTKMDDKIL IQETGEGTKN KMIVLDLSSI NGGAPGRTRG IVLDTVKSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)