AT3G50110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.904 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PTEN 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
PTEN 3 (PEN3); FUNCTIONS IN: phosphatase activity, protein tyrosine phosphatase activity, protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity; INVOLVED IN: protein amino acid dephosphorylation, dephosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein-tyrosine phosphatase, active site (InterPro:IPR016130), Phosphatase tensin type (InterPro:IPR014019), Dual specificity phosphatase, catalytic domain (InterPro:IPR000340), Tensin phosphatase, C2 domain (InterPro:IPR014020); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PTEN 2 (TAIR:AT3G19420.1); Has 4656 Blast hits to 2326 proteins in 274 species: Archae - 2; Bacteria - 2303; Metazoa - 1189; Fungi - 507; Plants - 170; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 481 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18580777..18583929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70076.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 632 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METDPANSSS KSPAVVSEKD VLIPEPSENT VGVVQDPVSA EREAHEDSIS TEASVAKVDD TQMPASSTGS EPLSKTDDIV PCPPGSSPRE SPPSIFSSSG 101: LSSWAKSFKF QQQDPNRTDS GMSAFTRFTS ELGLHLPTKG SEEVGDSRSS NTQVGGAFES LTKAVVDSSR GAVKAMQVKA RHIVSQNKRR YQEGEFDLDM 201: TYITENIIAM GFPAGDISSG LFGFFEGLYR NHMEEVIKFF ETHHKDKYKV YNLCSERLYD ASRFEGKVAS FPFDDHNCPP IQLIPSFCQS AYTWLKEDIQ 301: NVVVVHCKAG MARTGLMICC LLLYLKFFPT AEEAIDYYNQ KRCLDGKALV LPSQIRYVKY YERVQNQFDG KVPPERRCML RGFRLINCPY WIRPAITISN 401: HTDILFSTKK HQKTKDLGPE DFWIKAPKKG VVVFAIPGEA GLTELAGDFK IHFQDSDGDF YCWLNTTLTD NRTMLKGSDF DGFDKRKLPA PGFHVEIVMI 501: EPDNSQPTKS KSDSTQQQSQ SSSSADSSKL KSNEKDDDVF SDSDGEEEGN SQSYSTNEKT ASSMHTTSKP HQINEPPKRD DPSANRSVTS SSSSGHYNPI 601: PNNSLAVSDI KAIAADASVF SFGDEEEDYE SD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)