AT3G27290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.592 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RNI-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
RNI-like superfamily protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribonuclease inhibitor (TAIR:AT3G26000.1); Has 281 Blast hits to 274 proteins in 65 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 155; Fungi - 4; Plants - 111; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 11 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:10080038..10081265 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43127.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 382 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVNYERLRG SYNDYRKLEL GLGEFGDDFV GLPDDPFCMN IRSTLNSISD WFHENQIGLV SEDHTLPEDP FCMRVRSTLN TISDWFHENQ KEIGVVDQML 101: FETLSWFYNN DDDDGDDDDD GGGGGEAHDA FELVLPYLEL KEILAVEVVC RSLRDSVGKE PFFWTSIDLN DSFLQYRVTD ESLLKLTRRA LGGVRCLNLG 201: GCVGITDYGL KQVLASNPHL TKLSVSGCLR LSTAGLVSTL RDLKSSNRLG VKSLITGGAL YFTKEQFKEL NLLLGGDAKV GLQERKKRFY TSCRSEFYLE 301: DDRVTDLEIC PWCEKPSLVF DCPADTCPLK GQYPYSKSSC RACVVCIERC HECGSCLNDC ENKPFCFAFS CVVCIEKRSN RL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)