AT3G24030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.970 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : hydroxyethylthiazole kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
hydroxyethylthiazole kinase family protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity, hydroxyethylthiazole kinase activity; INVOLVED IN: thiamin biosynthetic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Hydroxyethylthiazole kinase (InterPro:IPR000417), Hydroxyethylthiazole kinase, monofunctional (InterPro:IPR011144); Has 2753 Blast hits to 2753 proteins in 1214 species: Archae - 124; Bacteria - 2340; Metazoa - 2; Fungi - 135; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 109 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:8679862..8680812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28796.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 276 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESKSEQNEW SSGVWAHLTA VRQQSPLVQC ITNFVSMDLV ANTLLSAGAS PAMVHSVVEI PDFTPHIHAL CVNVGTLTPD WLPSMKAAAE LASQLRKPWV 101: LDPAAVSCSG FRLKACLELI ELKPTVIKGN GSEIIALSSA SRGQTKGADS SHESTDAIEA AKSLAMSSGA VVAVSGAVDI VTDGKQVIGV HNGTKMMQQI 201: TATGCSLAGL IVAFLAIDSS RVLEATVSAM AVFGIAGELG EAMANGPASL RMHLIDCLYG LDETTVLKRV NVTRLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)