AT3G23410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.850 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fatty alcohol oxidase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a fatty alcohol oxidase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fatty alcohol oxidase 3 (FAO3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Glucose-methanol-choline oxidoreductase, N-terminal (InterPro:IPR000172), Glucose-methanol-choline oxidoreductase, C-terminal (InterPro:IPR007867), Long-chain fatty alcohol dehydrogenase (InterPro:IPR012400); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Long-chain fatty alcohol dehydrogenase family protein (TAIR:AT4G28570.1); Has 3017 Blast hits to 2907 proteins in 684 species: Archae - 34; Bacteria - 1847; Metazoa - 52; Fungi - 221; Plants - 173; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 690 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8382860..8386024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81393.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 746 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDKYKVAGKF GLPDITVAEM ESLASFCEAV LPSVQPPPEE LSGEGDNHRN KEALRSFYST SGSKTPVLRQ SIELVTKRGT IEAYIATRLI LFLLATRLGT 101: LLICGTECLV SRWPFVEKFS ELSLEKRERV LQKQFKNWIL TPIRAAFVYI KVAFLFCFFS RVNPNGENPA WEAIGYRVNP DENKPSETHN ERPLEKGIVE 201: TMEETEQTLL ESLAHKGLEA VLDTEHDAIR IKCDVVVVGS GSGGGVAASV LAKSGLKVVV LEKGSYFTPS EHRPFEGPGL DKLYENGGIL PSVDGSFMVL 301: AGATVGGGSA VNWSACIKTP KSVLQEWSED QNIPLFGTKE YLTAMEVVWK RMGVTEKCEL ESFQNQILRK GCENLGFNVE NVPRNSSESH YCGSCGYGCR 401: QGDKKGSDRT WLVDAVGHGA VILTGCKAER FILEKNGSNK GGKQMKCLGV MAKSLNGNIA KMLKIEAKVT VSAGGALLTP PLMISSGLRN RNIGKNLHLH 501: PVLMAWGYFP DKESSNISFK GNSYEGGIIT SVSKVLSEDS EVRAIIETPQ LGPGSFSVLT PWTSGLDMKK RMARYSRTAS LITIVRDRGS GEVKTEGRIN 601: YTVDKTDRDN LKAGLRESLR ILIAAGAEEV GTHRSDGQRL ICKGVNENSI QEFLDSVSTE EGAKGMTEKW NVYSSAHQMG SCRIGENEKE GAIDLNGESW 701: EAEKLFVCDA SALPSAVGVN PMITVMSTAY CISTRIAKSM TTGLSH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)