AT3G19930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sugar transporter 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a sucrose hydrogen symporter that is induced by wounding. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sugar transporter 4 (STP4); FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity, monosaccharide transmembrane transporter activity, sucrose:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: defense response to fungus, response to wounding, sucrose transport; LOCATED IN: plasma membrane, integral to plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT3G19940.1); Has 29502 Blast hits to 28992 proteins in 2095 species: Archae - 505; Bacteria - 13835; Metazoa - 4159; Fungi - 7125; Plants - 2571; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1305 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6935048..6936841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57098.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 514 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGGFVSQTP GVRNYNYKLT PKVFVTCFIG AFGGLIFGYD LGISGGVTSM EPFLEEFFPY VYKKMKSAHE NEYCRFDSQL LTLFTSSLYV AALVSSLFAS 101: TITRVFGRKW SMFLGGFTFF IGSAFNGFAQ NIAMLLIGRI LLGFGVGFAN QSVPVYLSEM APPNLRGAFN NGFQVAIIFG IVVATIINYF TAQMKGNIGW 201: RISLGLACVP AVMIMIGALI LPDTPNSLIE RGYTEEAKEM LQSIRGTNEV DEEFQDLIDA SEESKQVKHP WKNIMLPRYR PQLIMTCFIP FFQQLTGINV 301: ITFYAPVLFQ TLGFGSKASL LSAMVTGIIE LLCTFVSVFT VDRFGRRILF LQGGIQMLVS QIAIGAMIGV KFGVAGTGNI GKSDANLIVA LICIYVAGFA 401: WSWGPLGWLV PSEISPLEIR SAAQAINVSV NMFFTFLVAQ LFLTMLCHMK FGLFFFFAFF VVIMTIFIYL MLPETKNVPI EEMNRVWKAH WFWGKFIPDE 501: AVNMGAAEMQ QKSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)