AT3G19270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.618 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 707, subfamily A, polypeptide 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with ABA 8'-hydroxylase activity, involved in ABA catabolism. Member of the CYP707A gene family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 707, subfamily A, polypeptide 4 (CYP707A4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 707, subfamily A, polypeptide 1 (TAIR:AT4G19230.1); Has 34460 Blast hits to 34219 proteins in 1800 species: Archae - 82; Bacteria - 7577; Metazoa - 11415; Fungi - 5354; Plants - 8009; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 2017 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6673885..6676400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53925.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 468 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEIWFLVVP ILILCLLLVR VIVSKKKKNS RGKLPPGSMG WPYLGETLQL YSQNPNVFFT SKQKRYGEIF KTRILGYPCV MLASPEAARF VLVTHAHMFK 101: PTYPRSKEKL IGPSALFFHQ GDYHSHIRKL VQSSFYPETI RKLIPDIEHI ALSSLQSWAN MPIVSTYQEM KKFAFDVGIL AIFGHLESSY KEILKHNYNI 201: VDKGYNSFPM SLPGTSYHKA LMARKQLKTI VSEIICERRE KRALQTDFLG HLLNFKNEKG RVLTQEQIAD NIIGVLFAAQ DTTASCLTWI LKYLHDDQKL 301: LEAVKAEQKA IYEENSREKK PLTWRQTRNM PLTHKVIVES LRMASIISFT FREAVVDVEY KGYLIPKGWK VMPLFRNIHH NPKYFSNPEV FDPSRFEVNP 401: KPNTFMPFGS GVHACPGNEL AKLQILIFLH HLVSNFRWEV KGGEKGIQYS PFPIPQNGLP ATFRRHSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)