AT3G16430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.875 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : jacalin-related lectin 31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
jacalin-related lectin 31 (JAL31); FUNCTIONS IN: copper ion binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mannose-binding lectin (InterPro:IPR001229); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PYK10-binding protein 1 (TAIR:AT3G16420.3); Has 1533 Blast hits to 750 proteins in 40 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 1528; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:5581830..5582959 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32235.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 296 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQKVEAKGG KGGNQWDDGS DHDAVTKIQV AVGGMGIQYI QFDYVKNGQT EQTPLRGIKG STIPTDPFVI NHPEEHLVSI EIWYKPDGLI QGLRFISNKK 101: TSRFIGYDRG TRSFLQVQDK KIIGFHGSAG DNLNSLGAYF APLTIPLTPA KPLPALGSDD GTAWDDGAYV GVKKVYVGQA QDGISAVKFV YDKSPEEVTG 201: EEHGKSTLLG FEEFVLDYPS EYIIAVEGTY DKIFGSDGSV ITMLRFKTNK QTSPPFGLEA GTAFELKEEG HKIVGFHGRA DALLHKIGVH VRPVSN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)