AT3G03630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine synthase 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein that possesses S-sulfocysteine synthase activity and lacks O-acetylserien(thiol)lyase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine synthase 26 (CS26); FUNCTIONS IN: cysteine synthase activity; INVOLVED IN: regulation of hydrogen peroxide metabolic process, cysteine biosynthetic process, regulation of superoxide metabolic process, photosynthesis; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cysteine synthase/cystathionine beta-synthase P-phosphate-binding site (InterPro:IPR001216), Cysteine synthase A (InterPro:IPR005859), Pyridoxal phosphate-dependent enzyme, beta subunit (InterPro:IPR001926), Cysteine synthase K/M (InterPro:IPR005856); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: O-acetylserine (thiol) lyase isoform C (TAIR:AT3G59760.3); Has 20790 Blast hits to 20777 proteins in 2676 species: Archae - 415; Bacteria - 14597; Metazoa - 363; Fungi - 563; Plants - 551; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 4299 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:878388..880400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43163.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 404 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFASPSLRL LPQSPLGRIT SKLHRFSTAK LSLFSFHHDS SSSLAVRTPV SSFVVGAISG KSSTGTKSKS KTKRKPPPPP PVTTVAEEQH IAESETVNIA 101: EDVTQLIGST PMVYLNRVTD GCLADIAAKL ESMEPCRSVK DRIGLSMINE AENSGAITPR KTVLVEPTTG NTGLGIAFVA AAKGYKLIVT MPASINIERR 201: MLLRALGAEI VLTNPEKGLK GAVDKAKEIV LKTKNAYMFQ QFDNTANTKI HFETTGPEIW EDTMGNVDIF VAGIGTGGTV TGTGGFLKMM NKDIKVVGVE 301: PSERSVISGD NPGYLPGILD VKLLDEVFKV SNGEAIEMAR RLALEEGLLV GISSGAAAVA AVSLAKRAEN AGKLITVLFP SHGERYITTA LFSSINREVQ 401: EMRY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)