AT3G03480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.728 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acetyl CoA:(Z)-3-hexen-1-ol acetyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
acetyl CoA:(Z)-3-hexen-1-ol acetyltransferase (CHAT); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transferase (InterPro:IPR003480); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HXXXD-type acyl-transferase family protein (TAIR:AT5G17540.1); Has 2522 Blast hits to 2511 proteins in 130 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 44; Plants - 2476; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:828400..829863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50292.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 454 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDHQVSLPQS TTTGLSFKVH RQQRELVTPA KPTPRELKPL SDIDDQQGLR FQIPVIFFYR PNLSSDLDPV QVIKKALADA LVYYYPFAGR LRELSNRKLA 101: VDCTGEGVLF IEAEADVALA ELEEADALLP PFPFLEELLF DVEGSSDVLN TPLLLVQVTR LKCCGFIFAL RFNHTMTDGA GLSLFLKSLC ELACGLHAPS 201: VPPVWNRHLL TVSASEARVT HTHREYDDQV GIDVVATGHP LVSRSFFFRA EEISAIRKLL PPDLHNTSFE ALSSFLWRCR TIALNPDPNT EMRLTCIINS 301: RSKLRNPPLE PGYYGNVFVI PAAIATARDL IEKPLEFALR LIQETKSSVT EDYVRSVTAL MATRGRPMFV ASGNYIISDL RHFDLGKIDF GPWGKPVYGG 401: TAKAGIALFP GVSFYVPFKN KKGETGTVVA ISLPVRAMET FVAELNGVLN VSKG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)