AT2G46470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : inner membrane protein OXA1-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
inner membrane protein OXA1-like (OXA1L); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: protein import into mitochondrial inner membrane; LOCATED IN: mitochondrion, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membrane insertion protein, OxaA/YidC (InterPro:IPR001708), Membrane insertion protein, OxaA/YidC, core (InterPro:IPR020001); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homolog of yeast oxidase assembly 1 (OXA1) (TAIR:AT5G62050.1); Has 6999 Blast hits to 6999 proteins in 2412 species: Archae - 0; Bacteria - 4957; Metazoa - 240; Fungi - 210; Plants - 194; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1398 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:19072659..19074948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47900.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 431 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATCLRGITK RVNLLQRRVY PSCGHLIRDD RDETKSGSSD TMIREVLARN GTNKLSSMFA DRHYQSFATG PLGLGLSSCR HMSSTPPEWS DKVDGIDFVA 101: TEVVPDEIIE AVTTTSQAVV PAINEVAIAA ADSAFPVAAL QHLIDAVHSF TGLNWWASIA LTTVLIRGVT IPILLNQLKA TYKLNVLRPQ LEELRQEMST 201: KAQDPEAMAE GQRRMQLLFK EHGVTPFTPL KGLIIQGPIF ISFFFAIRNM AEKVPSFKTG GTLWFTDLTT TDTTYILPLL TAVTFLIMVE SNMQEGLEGN 301: PVAGTMKKFS RIIAFLSIPV LIGIEKALFC YWLTSNLFTL VYGLTLRRPD VRKLLNLPDV VNSSTRQPSP SSPLPFSFAE PKDQSVVAQE KPPMSSESSS 401: SVPDRRISRS SVLNQRIRTL ERQLKDRKIK K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)