AT2G45695.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.983 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ubiquitin related modifier 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ubiquitin related modifier 1; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin related modifier 1 (InterPro:IPR015221), Ubiquitin-related modifier 1 (InterPro:IPR017188), Molybdopterin synthase/thiamin biosynthesis sulphur carrier, beta-grasp (InterPro:IPR016155); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ubiquitin related modifier 1 (TAIR:AT3G61113.1); Has 341 Blast hits to 341 proteins in 169 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 124; Fungi - 124; Plants - 33; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 60 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18826043..18826744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11287.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 101 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQLTLEFGGG LELLCDSEKI HKVNVDLPNG ADSDDFTMKH LLSWVRTNLI KERPEMFMKG DTVRPGVLVL VNDCDWELSG QLDTVIEDKD VVVFISTLHG 101: G |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)