AT2G42690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.566 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alpha/beta-Hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: triglyceride lipase activity; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, class 3 (InterPro:IPR002921); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT4G18550.1); Has 772 Blast hits to 765 proteins in 118 species: Archae - 0; Bacteria - 26; Metazoa - 4; Fungi - 158; Plants - 461; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 122 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:17776356..17777682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46059.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 412 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTTTSWEE LLGSKNWDTI LDPLDQSLRE LILRCGDFCQ ATYDAFVNDQ NSKYCGASRY GKSSFFDKVM LENASDYEVV NFLYATARVS LPEGLLLQSQ 101: SRDSWDRESN WFGYIAVTSD ERSKALGRRE IYIALRGTSR NYEWVNVLGA RPTSADPLLH GPEQDGSGGV VEGTTFDSDS EDEEGCKVML GWLTIYTSNH 201: PESKFTKLSL RSQLLAKIKE LLLKYKDEKP SIVLTGHSLG ATEAVLAAYD IAENGSSDDV PVTAIVFGCP QVGNKEFRDE VMSHKNLKIL HVRNTIDLLT 301: RYPGGLLGYV DIGINFVIDT KKSPFLSDSR NPGDWHNLQA MLHVVAGWNG KKGEFKLMVK RSIALVNKSC EFLKAECLVP GSWWVEKNKG LIKNEDGEWV 401: LAPVEEEPVP EF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)