AT2G40190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative alpha-1,2-mannosyltransferase in N-linked glycoprotein (homologous to yeast ALG11). Plays vital roles in cell-wall biosynthesis and abiotic stress response. Located in endoplasmic reticulum membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
LEAF WILTING 3 (LEW3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, group 1 (InterPro:IPR001296); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT1G78800.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16785232..16787257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52575.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 463 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIYFILYTL LTIIFAVSLS LFLSVINARK SRKRAVGFFH PYTNDGGGGE RVLWCAVKAI QEENPDLDCV IFTGDHDSSS DSLARRAVDR FGVHLQSPPK 101: VIHLNKRKWI EESTYPHFTM IGQSLGSVYL AWEALRMFTP LYFLDTSGYA FTYPLARIFG CKVVCYTHYP TISLDMISRV RQRNSMYNND ASIAKSNWLS 201: TCKLVYYRAF SWMYGMVGSC THLAMVNSSW TKSHIEVLWR IPERITRVYP PCDTSGLQAF PLERSSDPPK IISVAQFRPE KAHMLQLEAF SLALEKLDAD 301: VPRPKLQFVG SCRNNSDEER LQKLKDRAVE LKVDGDVQFY KNAMYRELVE LLGNAVAGLH GMIDEHFGIS VVEYMAAGAI PIAHNSAGPK MDIVLEEDGQ 401: KTGFLAETVE EYAEAILEIV KMNETERLKM AESARKRAAR FSEQRFCEDF KTAIRPIFTG PLK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)