AT2G32440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ent-kaurenoic acid hydroxylase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ent-kaurenoic acid hydroxylase (KAO2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ent-kaurenoic acid hydroxylase 2 (KAO2); FUNCTIONS IN: ent-kaurenoate oxidase activity, oxygen binding; INVOLVED IN: gibberellin biosynthetic process; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450, B-class (InterPro:IPR002397), Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 88, subfamily A, polypeptide 3 (TAIR:AT1G05160.1); Has 35134 Blast hits to 35055 proteins in 1824 species: Archae - 82; Bacteria - 8009; Metazoa - 11074; Fungi - 6084; Plants - 7910; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1969 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13775668..13777783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56753.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 489 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTETGLILMW FPLIILGLFV LKWVLKRVNV WIYVSKLGEK KHYLPPGDLG WPVIGNMWSF LRAFKTSDPE SFIQSYITRY GRTGIYKAHM FGYPCVLVTT 101: PETCRRVLTD DDAFHIGWPK STMKLIGRKS FVGISFEEHK RLRRLTSAPV NGPEALSVYI QFIEETVNTD LEKWSKMGEI EFLSHLRKLT FKVIMYIFLS 201: SESEHVMDSL EREYTNLNYG VRAMGINLPG FAYHRALKAR KKLVAAFQSI VTNRRNQRKQ NISSNRKDML DNLIDVKDEN GRVLDDEEII DLLLMYLNAG 301: HESSGHLTMW ATILMQEHPM ILQKAKEEQE RIVKKRAPGQ KLTLKETREM VYLSQVIDET LRVITFSLTA FREAKSDVQM DGYIIPKGWK VLTWFRNVHL 401: DPEIYPDPKK FDPSRWEGYT PKAGTFLPFG LGSHLCPGND LAKLEISIFL HHFLLKYRVE RSNPGCPVMF LPHNRPKDNC LARITRTMP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)