AT2G32230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.500 plastid 0.500 ASURE: mitochondrion,plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : proteinaceous RNase P 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
RNase P able to cleave tRNA-like structures involved in the maturation of plant mitochondrial mRNAs. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
proteinaceous RNase P 1 (PRORP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Multi antimicrobial extrusion protein MatE (InterPro:IPR002528), Pentatricopeptide repeat (InterPro:IPR002885); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: proteinaceous RNase P 3 (TAIR:AT4G21900.1); Has 2190 Blast hits to 1686 proteins in 140 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 111; Fungi - 4; Plants - 1945; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 130 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13679608..13681756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64880.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 572 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLRLTCFTPS FSRACCPLFA MMLKVPSVHL HHPRFSPFRF YHTSLLVKGT RDRRLILVER SRHLCTLPLA AAKQSAASPS ENLSRKAKKK AIQQSPEALL 101: KQKLDMCSKK GDVLEALRLY DEARRNGVQL SQYHYNVLLY VCSLAEAATE SSPNPGLSRG FDIFKQMIVD KVVPNEATFT NGARLAVAKD DPEMAFDMVK 201: QMKAFGIQPR LRSYGPALFG FCRKGDADKA YEVDAHMVES EVVPEEPELA ALLKVSMDTK NADKVYKTLQ RLRDLVRQVS KSTFDMIEEW FKSEVATKTG 301: VKKWDVKKIR DAVVSGGGGW HGQGWLGTGK WNVKRTEMDE NGVCKCCKEK LVCIDINPVE TETFAASLTR LACEREVKAN FNQFQEWLER HGPFDAVIDG 401: ANMGLVNQRS FSFFQLNNTV QRCQQISPSK RLPLVILHKS RVNGGPATYP KNRALLEKWK NAGALYATPP GSNDDWYWLY AAVSCKCLLV TNDEMRDHLF 501: QLLGNSFFPR WKEKHQVRIS VTREDGLKLN MPPPYSIVIQ ESEDGTWHVP MSVEDDLQTS RQWLCAKRSK TP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)