AT2G29080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FTSH protease 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an FtsH protease that is localized to the mitochondrion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FTSH protease 3 (ftsh3); FUNCTIONS IN: ATP-dependent peptidase activity, ATPase activity; INVOLVED IN: proteolysis, protein catabolic process; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast thylakoid membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M41, FtsH (InterPro:IPR005936), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), ATPase, AAA-type, conserved site (InterPro:IPR003960), Peptidase M41 (InterPro:IPR000642), Peptidase M41, FtsH extracellular (InterPro:IPR011546); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FTSH protease 10 (TAIR:AT1G07510.1); Has 42068 Blast hits to 39734 proteins in 3332 species: Archae - 1581; Bacteria - 17420; Metazoa - 4814; Fungi - 3774; Plants - 3280; Viruses - 30; Other Eukaryotes - 11169 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12489911..12492999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 89357.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 809 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTMIFFSKLN RSISRSKGFL YGGGVRSAAR LLTSPGLEAA SVNEVEGGLG FIRRHFASLA SRKGLVNNDL IGVFANPRLR RFFSDEAPKK KNYENYFPKD 101: KQEPKSDQKS EHKEGSEKNE NENVGDMFMN RFQNLLIPLL ALAVFFSTFS FGSGEQQQIS FQEFKNKLLE PGLVDHIDVS NKSVAKVYVR STPKDQQTTD 201: VVHGNGNGIP AKRTGGQYKY YFNIGSVDSF EEKLEEAQEA LGVDRHEYVP VTYVSEMVWY QEFMRFAPTL LLLGTLIYGA RRMQGGLGVG GTGGKNGRGI 301: FNIGKATITR ADKHSKNKIY FKDVAGCDEA KQEIMEFVHF LKNPKKYEDL GAKIPKGALL VGPPGTGKTL LAKATAGESG VPFLSISGSD FMEMFVGVGP 401: SRVRHLFQEA RQAAPSIIFI DEIDAIGRAR GRGGLGGNDE RESTLNQLLV EMDGFGTTAG VVVLAGTNRP DILDKALLRP GRFDRQITID KPDIKGRDQI 501: FKIYLKKIKL DHEPSYYSQR LAALTPGFAG ADIANVCNEA ALIAARHEGA TVTMAHFESA IDRVIGGLEK KNRVISKLER RTVAYHESGH AVVGWFLEHA 601: EPLLKVTIVP RGTAALGFAQ YVPNENLLMT KEQLFDMTCM TLGGRAAEQV LIGKISTGAQ NDLEKVTKMT YAQVAVYGFS DKVGLLSFPP RDDGYDFSKP 701: YSNKTGAIID EEVRDWVAKA YERTVELVEE HKVKVAEIAE LLLEKEVLHQ DDLLKILGER PFKSAEVTNY DRFKSGFEET EKDSAATPTV EPVVDDGAPP 801: PFEPQVVPT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)