AT2G26740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : soluble epoxide hydrolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a soluble epoxide hydrolase whose expression is induced by auxin and water stress. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
soluble epoxide hydrolase (SEH); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Epoxide hydrolase-like (InterPro:IPR000639), Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT2G26750.1); Has 16813 Blast hits to 16796 proteins in 1664 species: Archae - 95; Bacteria - 12002; Metazoa - 658; Fungi - 513; Plants - 624; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2918 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11393148..11394257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36425.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 321 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEHRKVRGNG IDIHVAIQGP SDGPIVLLLH GFPELWYSWR HQIPGLAARG YRAVAPDLRG YGDSDAPAEI SSYTCFNIVG DLIAVISALT ASEDEKVFVV 101: GHDWGALIAW YLCLFRPDRV KALVNLSVPF SFRPTDPSVK PVDRMRAFYG DDYYICRFQE FGDVEAEIAE VGTERVMKRL LTYRTPGPVI IPKDKSFWGS 201: KGETIPLPSW LTEEDVAYFV SKFEEKGFSG PVNYYRNFNR NNELLGPWVG SKIQVPTKFV IGELDLVYYM PGVKEYIHGP QFKEDVPLLE EPVVMEGVAH 301: FINQEKPQEI LQIILDFISK F |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)