AT2G23790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF607) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein of unknown function (DUF607); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF607 (InterPro:IPR006769); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF607) (TAIR:AT4G36820.1); Has 364 Blast hits to 364 proteins in 117 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 147; Fungi - 45; Plants - 131; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 41 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10125692..10127455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38179.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 336 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMRKLLSKK LFNITNVASQ SLMNCRISSS SLAVRTRVPN DSTDTTKIAP EPGDLAMSRR FMHNSAMIRP AEIMQMPVGE SLIEKLREID GSKDRIRLDG 101: LSPPERETSL TVADTKKLLR AAQIEIVKSK LRETGRSWMP YKEFVSVCGE ASSDPDLGSK IAKMLDDSAN VIVLGDSVCI RPDQVTKSIE GLLPLPKIHN 201: PNDPRRIEFK ELEAEKAVID VKAHTLVRKE LWAGLGYLIL QTAGFMRLTF WELSWDVMEP ICFYVTSVYF MAGYAFFLRT SKEPSFEGFY QSRFEAKQRK 301: LMNEYEFDLE RYNELKKLFC SKPSDHVSKI LGAIKS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)