AT2G21550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.992 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Bifunctional dihydrofolate reductase/thymidylate synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Bifunctional dihydrofolate reductase/thymidylate synthase; FUNCTIONS IN: thymidylate synthase activity, dihydrofolate reductase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, glycine biosynthetic process, one-carbon metabolic process, nucleotide biosynthetic process, dTMP biosynthetic process; EXPRESSED IN: stem, hypocotyl, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydrofolate reductase domain (InterPro:IPR001796), Dihydrofolate reductase conserved site (InterPro:IPR017925), Bifunctional dihydrofolate reductase/thymidylate synthase (InterPro:IPR012262), Thymidylate synthase (InterPro:IPR000398); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: thymidylate synthase 1 (TAIR:AT2G16370.1); Has 12633 Blast hits to 12576 proteins in 2517 species: Archae - 33; Bacteria - 8296; Metazoa - 499; Fungi - 419; Plants - 87; Viruses - 227; Other Eukaryotes - 3072 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9227209..9230189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55324.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 492 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASTGETICN NGQSAVSVTR RRSYQVVIAA TRDMGLGMDM KLPWDLPSEY QFFQDVTTRT SDPTKRNATI MGRKSWESTP LEIRPLPGRL NIVLTKSSCH 101: NIAIDENVLV SSSMESALEL LATEPYSLSI EKVFVIGGGE LLRNYMNASI CDAIHLTEID ISVPCDAFAP RVDTSLYRPW YSSFPVVENG IRYSFNTYVR 201: RKDAIVGSGE KKSVAESDLK EYSFLPKMVF ERHEEFGYLN LVQNIISSGD MNDNSTLSKF GCQMRFNLRK TFPLLTTKKI FWLGVVEEIL QLISGSNNPK 301: ENGSHIWDTD EAKEYLDSFG VNATEEDGDN PFLHGLHWKH CDARFVIQEF SQLSDVINKI KNNPHDQRIM LAACNPLDFK LSVSPCHTFT QFYVANGEVS 401: CQIYQSSTEA SIGIPFSIAT YSLLTCIIAH VCDLGAGDFI HVIGQAYINK AHVKAIQKQL QISPKPFPIL KINPEKKKMD NFEASDLELM RI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)