AT2G20850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : STRUBBELIG-receptor family 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
STRUBBELIG-receptor family 1 (SRF1); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: STRUBBELIG-receptor family 3 (TAIR:AT4G03390.1); Has 150345 Blast hits to 104966 proteins in 4098 species: Archae - 89; Bacteria - 11039; Metazoa - 39266; Fungi - 7103; Plants - 77215; Viruses - 282; Other Eukaryotes - 15351 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8975670..8979182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 84828.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 775 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRSMRSGRDN NICFLGFLSF ALISLPSLSL ALTNPDDVAA INSLFLALES PLLPGWVASG GDPCGESWQG VLCNASQVET IILISANLGG ELGVGLNMFT 101: SLKAMDFSNN HIGGSIPSTL PVSLQNLFLS GNNFTGTIPE SLSSLKSLSV MSLNNNLLSG KIPDVFQDLG LMINIDLSSN NLSGPLPPSM QNLSTLTSLL 201: LQNNHLSGEL DVLQDLPLKD LNVENNLFNG PIPEKLLSIP NFIKGGNLFN VTIAPSPSPE TPPSPTSPKR PFFGPPSPNA SAGHGQAHVR SPPSDHHPSR 301: PTPQGKEDSF TSKRIIWISI LGAFSFVVLA LVCLLCGRKC LRKREDSEQL SKPHLTSEYG RAREGSRSNA SMLPPSNTFN KDKEARPKER VGGASKLHGG 401: AERSVGSESK QESHEIDMNG NAMDLMHPSS IPPIKRVIAK ATEPAEASLK RTTSKSHGPL TAVKHFTVAS LQQHTNSFSH ENLIGTGMLG SVYRAELPGG 501: KLFAVRKLDK KSPNHEEEGK FLELVNNIDR IRHANIVQLV GFCSEHSQRL LIHEYCRNGT LHDLLHIDDR LKIELSWNVR VRIALEAAKA LEYLHEICDP 601: PSIHRNFKSA NILLDDDIRV HVSDCGLAPL ISSGAVSQLS GQLLAAYGYG APEFEYGIYT MKCDVYSFGV VMLELLTGRK SYDKKRDRGE QFLVRWAIPQ 701: LHDIDALAKM VDPSLKGDYP AKSLSHFADV ISRCVQSEPE YRPLMSEVVQ DLSDMIQREH RRNDSNGDNQ YTGRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)