AT2G17265.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
onion epidermal cell layer (peroxisomal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homoserine kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a homoserine kinase (HSK) which produces O-phospho-L-homoserine (HserP), a compound at the branching point of methionine and threonine biosynthesis. HSK is found in the stromal fraction of chloroplasts. Mutants are susceptible to downy mildew fungus Hyaloperonospora parasitica. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homoserine kinase (HSK); FUNCTIONS IN: homoserine kinase activity; INVOLVED IN: methionine biosynthetic process, threonine biosynthetic process, response to fungus, response to bacterium; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GHMP kinase, ATP-binding, conserved site (InterPro:IPR006203), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), GHMP kinase (InterPro:IPR006204), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), Homoserine kinase (InterPro:IPR000870), GHMP kinase, C-terminal (InterPro:IPR013750); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homoserine kinase, putative / HSK, putative (TAIR:AT4G35295.1); Has 6092 Blast hits to 6088 proteins in 1935 species: Archae - 296; Bacteria - 4868; Metazoa - 7; Fungi - 124; Plants - 47; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 750 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7508606..7509718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38530.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 370 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLCFQSPS KPISYFQPKS NPSPPLFAKV SVFRCRASVQ TLVAVEPEPV FVSVKTFAPA TVANLGPGFD FLGCAVDGLG DHVTLRVDPS VRAGEVSISE 101: ITGTTTKLST NPLRNCAGIA AIATMKMLGI RSVGLSLDLH KGLPLGSGLG SSAASAAAAA VAVNEIFGRK LGSDQLVLAG LESEAKVSGY HADNIAPAIM 201: GGFVLIRNYE PLDLKPLRFP SDKDLFFVLV SPDFEAPTKK MRAALPTEIP MVHHVWNSSQ AAALVAAVLE GDAVMLGKAL SSDKIVEPTR APLIPGMEAV 301: KKAALEAGAF GCTISGAGPT AVAVIDSEEK GQVIGEKMVE AFWKVGHLKS VASVKKLDNV GARLVNSVSR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)