AT2G14260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.958 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : proline iminopeptidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes proline iminopeptidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
proline iminopeptidase (PIP); FUNCTIONS IN: aminopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S33, proline iminopeptidase 1 (InterPro:IPR005944), Peptidase S33, prolyl aminopeptidase (InterPro:IPR002410), Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); Has 7088 Blast hits to 7086 proteins in 1443 species: Archae - 32; Bacteria - 5306; Metazoa - 56; Fungi - 142; Plants - 129; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1423 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:6041441..6043869 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43061.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 380 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNLILASFSL APCFCVRFFP SNHNNLNLLF PGQRKIQVSC GGKSEVLKSD TMEPHEAETF VNKRTLYAPI EPYSSGNLKV SDVHTLYWEQ SGKPDGHPVV 101: FLHGGPGGGT APSNRRFFDP EFYRIVLFDQ RGAGKSTPHA CLEENTTWDL VNDIEKLREH LKIPEWLVFG GSWGSTLALA YSQSHPDKVT GLVLRGIFLL 201: RKKEIDWFYE GGAAAIYPDA WEEFRDLIPE NERGSSLVDA YHKRLNSDDL EIQYAAARAW TKWEMMTAYL RPNLENVQKA EDDKFSLAFA RIENHYFVNK 301: GFFPSDSHLL DNVDKIRHIK TTIVQGRYDV CCPMMSAWDL HKAWPEAELK IVYDAGHSAN EPGISAELVV ANEKMKALMG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)