AT2G13810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : AGD2-like defense response protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
AGD2-like defense response protein 1 (ALD1); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring nitrogenous groups, pyridoxal phosphate binding, transaminase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: asparagine catabolic process, biosynthetic process, glutamate catabolic process to oxaloacetate, aspartate transamidation; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: sepal, root, stamen; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: LL-diaminopimelate aminotransferase, plant-related (InterPro:IPR019942), Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein (TAIR:AT4G33680.1); Has 32741 Blast hits to 32741 proteins in 2900 species: Archae - 975; Bacteria - 23252; Metazoa - 372; Fungi - 435; Plants - 591; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7116 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:5768489..5772138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50580.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 456 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSLMFFSSA SPLCSSPSKI PKASLDFEMK KLGGSTKLVR NVNLEKLKNN YLFPEINRRE LEHIEKHPNV QLISLGTGDT TEPIPEQITS HMSNFAHGLS 101: TVEGYRGYGL EQGNKTLRKA IAETFYRDLH VKSNEVFVSD GAQSDISRLQ LLLGSNVTIA VQDPTFPAYI DSSVIIGQTG HFHEKTKKYQ NVVYMPCGPN 201: NSFFPDLAMT PRTDVIFFCS PNNPTGYVAS RKQLHQLVDF AKTNGSIIIF DSAYAAFIED GSPRSIYEIP GAREVAIEVS SFSKFAGFTG VRLGWSIIPD 301: ELLYSNGFPI INDFHRIVTT SFNGASNIAQ AGGLACLSSG GLKEIRSVNN YYKENRKILM DTLVSLGLKV YGGVNAPYLW VHFKGSKSWD VFNEILENTH 401: IITVPGSGFG PGGEEYLRIS GFGRRDHIVE ASKRLQNFFN TRTKHFTYLS STSNTN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)