AT2G13650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : golgi nucleotide sugar transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a Golgi-localized GDP-mannose transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
golgi nucleotide sugar transporter 1 (GONST1); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: golgi nucleotide sugar transporter 2 (TAIR:AT1G07290.1); Has 1741 Blast hits to 1741 proteins in 244 species: Archae - 2; Bacteria - 16; Metazoa - 451; Fungi - 288; Plants - 806; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 178 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:5687584..5690303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36841.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 333 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLYEHDGVD LEDGKTVKSG GDKPIPRKIH NRALLSGLAY CISSCSMILV NKFVLSSYNF NAGIFLMLYQ NFVSVIIVVG LSLMGLITTE PLTLRLMKVW 101: FPVNVIFVGM LITSMFSLKY INVAMVTVLK NVTNVITAVG EMYLFNKQHD NRVWAALFLM IISAVSGGIT DLSFNAVGYA WQIANCFLTA SYSLTLRKTM 201: DTAKQVTQSG NLNEFSMVLL NNTLSLPLGL LLSYFFNEMD YLYQTPLLRL PSFWMVMTLS GLLGLAISFT SMWFLHQTGA TTYSLVGSLN KIPLSIAGIV 301: LFNVPTSLQN SASILFGLVA GVVFARAKMR EKS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)