AT2G03220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Glycosyltransferase Family- 37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 1 (FT1); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: plant-type cell wall biogenesis, xyloglucan biosynthetic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xyloglucan fucosyltransferase (InterPro:IPR004938); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 7 (TAIR:AT1G14070.1); Has 329 Blast hits to 320 proteins in 18 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 326; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:970401..972353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63455.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 558 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQNSYRRRS SPIRTTTGGS KSVNFSELLQ MKYLSSGTMK LTRTFTTCLI VFSVLVAFSM IFHQHPSDSN RIMGFAEARV LDAGVFPNVT NINSDKLLGG 101: LLASGFDEDS CLSRYQSVHY RKPSPYKPSS YLISKLRNYE KLHKRCGPGT ESYKKALKQL DQEHIDGDGE CKYVVWISFS GLGNRILSLA SVFLYALLTD 201: RVLLVDRGKD MDDLFCEPFL GMSWLLPLDF PMTDQFDGLN QESSRCYGYM VKNQVIDTEG TLSHLYLHLV HDYGDHDKMF FCEGDQTFIG KVPWLIVKTD 301: NYFVPSLWLI PGFDDELNKL FPQKATVFHH LGRYLFHPTN QVWGLVTRYY EAYLSHADEK IGIQVRVFDE DPGPFQHVMD QISSCTQKEK LLPEVDTLVE 401: RSRHVNTPKH KAVLVTSLNA GYAENLKSMY WEYPTSTGEI IGVHQPSQEG YQQTEKKMHN GKALAEMYLL SLTDNLVTSA WSTFGYVAQG LGGLKPWILY 501: RPENRTTPDP SCGRAMSMEP CFHSPPFYDC KAKTGIDTGT LVPHVRHCED ISWGLKLV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)