AT2G01690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ARM repeat superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ARM repeat superfamily protein; FUNCTIONS IN: binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: HEAT (InterPro:IPR000357), Armadillo-like helical (InterPro:IPR011989), Protein of unknown function DUF3434 (InterPro:IPR021841), HEAT, type 2 (InterPro:IPR021133), Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024); Has 6269 Blast hits to 4446 proteins in 336 species: Archae - 2; Bacteria - 171; Metazoa - 2181; Fungi - 947; Plants - 235; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 2722 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:309144..313499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83916.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 743 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSDALSAIPA AVHRNLSDKL YEKRKNAALE LENIVKNLTS SGDHDKISKV IEMLIKEFAK SPQANHRKGG LIGLAAVTVG LSTEAAQYLE QIVPPVINSF 101: SDQDSRVRYY ACEALYNIAK VVRGDFIIFF NKIFDALCKL SADSDANVQS AAHLLDRLVK DIVTESDQFS IEEFIPLLKE RMNVLNPYVR QFLVGWITVL 201: DSVPDIDMLG FLPDFLDGLF NMLSDSSHEI RQQADSALSE FLQEIKNSPS VDYGRMAEIL VQRAASPDEF TRLTAITWIN EFVKLGGDQL VRYYADILGA 301: ILPCISDKEE KIRVVARETN EELRSIHVEP SDGFDVGAIL SVARRQLSSE FEATRIEALN WISTLLNKHR TEVLCFLNDI FDTLLKALSD SSDDVVLLVL 401: EVHAGVAKDP QHFRQLIVFL VHNFRADNSL LERRGALIVR RMCVLLDAER VYRELSTILE GEDNLDFAST MVQALNLILL TSPELSKLRE LLKGSLVNRE 501: GKELFVALYT SWCHSPMAII SLCLLAQAYQ HASVVIQSLV EEDINVKFLV QLDKLIRLLE TPIFTYLRLQ LLEPGRYTWL LKTLYGLLML LPQQSAAFKI 601: LRTRLKTVPT YSFSTGNQIG RATSGVPFSQ YKHQNEDGDL EDDNINSSHQ GINFAVRLQQ FENVQNLHRG QARTRVNYSY HSSSSSTSKE VRRSEEQQQQ 701: QQQQQQQQQQ QQRPPPSSTS SSVADNNRPP SRTSRKGPGQ LQL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)