AT1G80900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : magnesium transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Transmembrane magnesium transporter. One of nine family members. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
magnesium transporter 1 (MGT1); FUNCTIONS IN: magnesium ion transmembrane transporter activity, metal ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transmembrane transport, metal ion transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 29 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mg2+ transporter protein, CorA-like (InterPro:IPR002523); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: magnesium transporter 2 (TAIR:AT1G16010.3); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:30398289..30399870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50465.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 443 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSELKERLLP PRPASAINLR GDAGSRPSPS GRQPLLGVDV LGLKKRGQGL KSWIRVDTSA NSQVIEVDKF TMMRRCDLPA RDLRLLDPLF VYPSTILGRE 101: KAIVVNLEQI RCIITADEVL LLNSLDNYVL RYVVELQQRL KASSVTEVWN QDSLELSRRR SRSLDNVLQN SSPDYLPFEF RALEVALEAA CTFLDSQASE 201: LEIEAYPLLD ELTSKISTLN LERARRLKSR LVALTRRVQK VRDEIEQLMD DDGDMAEMYL TEKKKRMEGS LYGDQSLPVY RTNDCFSLSA PVSPVSSPPE 301: SRRLEKSLSI VRSRHDSARS SEDATENIEE LEMLLEAYFV VIDSTLNKLT SLKEYIDDTE DFINIQLDNV RNQLIQFELL LTTATFVVAI FGVVAGIFGM 401: NFEIDFFEKP GAFKWVLAIT GVCGLVVFLA FLWYYKRRRL MPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)