AT1G80230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Rubredoxin-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Rubredoxin-like superfamily protein; FUNCTIONS IN: cytochrome-c oxidase activity; LOCATED IN: mitochondrial envelope, mitochondrion; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome c oxidase, subunit Vb (InterPro:IPR002124); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Rubredoxin-like superfamily protein (TAIR:AT3G15640.1); Has 455 Blast hits to 455 proteins in 164 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 230; Fungi - 89; Plants - 94; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 42 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:30169784..30170999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18583.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 171 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWRRIVSSHL KSISAVGSCA APSCRHAVVE STHLSLSTRA SSIPAYSSIF SRLIGSAAAD TAVKKRVEDV MPIATGHEKE ELQAELEGRK LDDIDFPEGP 101: FGTKEAPAVV KSYYDMRIVG CPGGEGEDEH DVVWFWLEKG KSFECPVCTQ YFKLEVVGPG GPPDGHGDDH H |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)