AT1G77810.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.835 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Galactosyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, beta-1,3-galactosyltransferase activity; INVOLVED IN: protein amino acid glycosylation; LOCATED IN: Golgi apparatus; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT1G22015.1); Has 1384 Blast hits to 1375 proteins in 95 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 812; Fungi - 0; Plants - 549; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 21 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:29260899..29263001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44677.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKHKVSKRVI SLKWVPFLCI SFFALGAIFT SRSWEPSSDS GSQLISQHHR DHELQIVSDD CAHNKKATQE KDVTGEVLRT HEAIQDDRSL DKSVSTLSST 101: RSSQEMVDGS ETNPRKKVFM VMGINTAFSS RKRRDSVRET WMPQGEKLER LEQEKGIVIK FMIGHSATSN SILDRAIDSE DAQHKDFLRL EHVEGYHELS 201: AKTKIFFSTA VAKWDAEFYI KVDDDVHVNL GMLASTLARH RSKPRVYIGC MKSGPVLAQN LLNCFRTVKY HEPEYWKFGE DGNKYFRHAT GQIYAISKDL 301: ANYISINQPI LHKYANEDVS LGSWFIGLEV EHIDDRNFCC GTPPDCRWKA EAGDVCVASF EWSCSGICKS VERMKIVHEV CSEGEGAVWN TLL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)