AT1G77740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes PIP5K2, a phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase (PtdIns(4)P 5-kinase 2; or PIP5K2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase 2 (PIP5K2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core, subgroup (InterPro:IPR016034), Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, plant (InterPro:IPR017163), MORN motif (InterPro:IPR003409), Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, core (InterPro:IPR002498); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase 1 (TAIR:AT1G21980.1); Has 28568 Blast hits to 7904 proteins in 613 species: Archae - 0; Bacteria - 4095; Metazoa - 4135; Fungi - 445; Plants - 2701; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17192 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29220632..29223861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 86349.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 754 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMREPLVSEE EEEEATEVLL VEKTKLCKRR GDEEKTEERR DDLLLLALTP MVRSKSQGTT RRVTPTPPPV DVEKPLPNGD LYMGTFSGGF PNGSGKYLWK 101: DGCMYEGEWK RGKASGKGKF SWPSGATYEG EFKSGRMEGS GTFVGVDGDT YRGSWVADRK QGHGQKRYAN GDYYEGTWRR NLQDGRGRYV WMNGNQYTGE 201: WRNGVICGKG VLAWPNGNRY EGQWENGVPK GSGVFTWADG SSWIGSWNES SNLMRNFFDG IEKNELIVAT RKRSSVDSGA GSLTGEKIFP RICIWESDGE 301: AGDITCDIVD NVEASVIYRD RISIDKDGFR QFRKNPCCFS GEAKKPGETI SKGHKKYDLM LNLQHGIRYS VGKHASVVRD LKQSDFDPSE KFWTRFPPEG 401: SKTTPPHLSV DFRWKDYCPL VFRRLRELFT VDPADYMLAI CGNDALRELS SPGKSGSFFY LTQDDRFMIK TVKKSEVKVL LRMLPSYYKH VCQYENTLVT 501: RFYGVHCIKP VGGQKTRFIV MGNLFCSEYR IQRRFDLKGS SHGRYTSKPE GEIDETTTLK DLDLNFAFRL QRNWYQELMT QIKRDCEFLE AERIMDYSLL 601: VGVHFRDDNT GDKMGLSPFV LRSGKIESYQ SEKFMRGCRF LEAELQDMDR ILAGRKPLIR LGANMPARAE RMARRSDYDQ YSSGGTNYQS HGEVYEVVLY 701: FGIIDILQDY DISKKIEHAY KSLQADPASI SAVDPKLYSR RFRDFISRIF IEDG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)