AT1G77260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.577 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT2G39750.1); Has 919 Blast hits to 909 proteins in 49 species: Archae - 0; Bacteria - 17; Metazoa - 3; Fungi - 4; Plants - 891; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:29023961..29026699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74452.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 655 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLSDVGLDV VKTPRLVKLI AFAFLSISTI FLFNHFSDSF SYPSLPFPIS SSSNVTEAIQ TNITSVAAVA PSPPPRPRLK ISPPPLPPTV VRTGIINENG 101: AMSDSFEIGG FDPDSIDELK SATGNSSVEE KESPEVGFQI EKLKLCDKTK IDYIPCLDNE EEIKRLNNTD RGENYERHCP KQSLDCLIPP PDGYKKPIQW 201: PQSRDKIWFN NVPHTRLVED KGGQNWIRRE KDKFVFPGGG TQFIHGADQY LDQISQMIPD ITFGSRTRVA LDIGCGVASF GAFLMQRNTT TLSVAPKDVH 301: ENQIQFALER GVPAMVAVFA TRRLLYPSQS FEMIHCSRCR INWTRDDGIL LLEVNRMLRA GGYFVWAAQP VYKHEDNLQE QWKEMLDLTN RICWELIKKE 401: GYIAVWRKPL NNSCYVSREA GTKPPLCRPD DDPDDVWYVD MKPCITRLPD NGYGANVSTW PARLHDPPER LQSIQMDAYI SRKEIMKAES RFWLEVVESY 501: VRVFRWKEFK LRNVLDMRAG FGGFAAALND LGLDCWVMNI VPVSGFNTLP VIYDRGLQGA MHDWCEPFDT YPRTYDLIHA AFLFSVEKKR CNITNIMLEM 601: DRMLRPGGHV YIRDSLSLMD QLQQVAKAIG WTAGVHDTGE GPHASVRILI CDKRI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)