AT1G76080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chloroplastic drought-induced stress protein of 32 kD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a thioredoxin localized in chloroplast stroma. Known as CDSP32 (CHLOROPLASTIC DROUGHT-INDUCED STRESS PROTEIN OF 32 KD). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chloroplastic drought-induced stress protein of 32 kD (CDSP32); INVOLVED IN: cell redox homeostasis; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin, core (InterPro:IPR015467), Thioredoxin domain (InterPro:IPR013766), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Thioredoxin superfamily protein (TAIR:AT1G19730.1); Has 3263 Blast hits to 3026 proteins in 903 species: Archae - 63; Bacteria - 1344; Metazoa - 643; Fungi - 77; Plants - 661; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 472 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28548063..28549348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33686.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 302 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATVANFLAK PISTVVPRPS SAVASTSSFV FFNHKTNPLF RRKNLPKRLF SAVKIKAGAA SPGKVGTPPA NDEKVQKIHS GEEFDVALKN AKSKLVVAEF 101: ATSKSDQSNK IYPFMVELSR TCNDVVFLLV MGDESDKTRE LCRREKIEKV PHFSFYKSME KIHEEEGIEP DQLMGDVLYY GDNHSAVVQL HGRPDVEKLI 201: DENRTGGKLI VLDVGLKHCG PCVKVYPTVL KLSRSMSETV VFARMNGDEN DSCMEFLKDM NVIEVPTFLF IRDGEIRGRY VGSGKGELIG EILRYSGVRV 301: TY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)