AT1G67490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glucosidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an alpha-glucosidase I enzyme that catalyzes the first step in N-linked glycan processing. Localized to the endoplasmic reticulum (ER). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glucosidase 1 (GCS1); FUNCTIONS IN: alpha-glucosidase activity; INVOLVED IN: root epidermal cell differentiation, epidermal cell differentiation; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 63 (InterPro:IPR004888), Six-hairpin glycosidase-like (InterPro:IPR008928); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Six-hairpin glycosidases superfamily protein (TAIR:AT1G24320.1); Has 477 Blast hits to 469 proteins in 208 species: Archae - 2; Bacteria - 128; Metazoa - 110; Fungi - 127; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 67 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25280633..25286581 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 97639.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 852 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTGASRRSAR GRIKSSSLSP GSDEGSAYPP SIRRGKGKEL VSIGAFKTNL KILVGLIILG IIVIYFVINR LVRHGLLFDE SQKPRVITPF PAPKVMDLSM 101: FQGEHKESLY WGTYRPHVYF GVRARTPLSL VAGLMWLGVK DEMYVMRHFC ENSDDLSTFG WREHNGRDYG RQELVENDMV IETSFVKSKG DGLGYGGDWA 201: VRIDVKNKGL NDDVKRSAHL FFYLADEGGN VLNLGQDGLD FQGSSLLVSG SREDVGDWQI HLKSQNQLET HYSGFKTPHI YNLSDLVQQN LALQARKFGR 301: LQLSDTSEDS SNIYIFQISG RLPFTIDIPF ISGIKGESSN VEKRLTSLTG LPLSDLLKKK HQEFDAKFNE CFKLSEKHDS ETLGVGRTAI ANMLGGIGYF 401: YGQSKIYVPK STQPGSRDNF LLYWPAELYT AVPSRPFFPR GFLWDEGFHQ LLIWRWDIRI TLDIVGHWLD LLNIDGWIPR EQILGAEALS KVPEEFVVQY 501: PSNGNPPTLF LVIRDLIDAI RMEKFVASEK DEVLSFLERA SVRLDAWFQW FNTSQKGKEI GSYFWHGRDN TTTQELNPKT LSSGLDDYPR ASHPSEDERH 601: VDLRCWMYLA ADCMHSITEL LGKEDKLSKE NYNSTVKLLS NFNLLNQMHY DSDYGAYFDF GNHTEKVKLI WKEVIQENGQ LSRQLVRKTF GKPKLKLVPH 701: LGYVSFFPFM SRIIPPDSPI LEKQLDLISN RSILWSDYGL VSLAKTSSMY MKRNTEHDAP YWRGPIWMNM NYMILSSLYH YSIVDGPYRE KSKAIYTELR 801: SNLIRNVVRN YYETGYIWEQ YDQVKGTGKG TRLFTGWSAL TLLIMSEDYP IF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)