AT1G62810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Copper amine oxidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Copper amine oxidase family protein; FUNCTIONS IN: primary amine oxidase activity, quinone binding, copper ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, amine metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Copper amine oxidase, N-terminal (InterPro:IPR016182), Copper amine oxidase, N2-terminal (InterPro:IPR015800), Copper amine oxidase, N2/N3-terminal (InterPro:IPR015801), Copper amine oxidase, N3-terminal (InterPro:IPR015802), Copper amine oxidase (InterPro:IPR000269), Copper amine oxidase, C-terminal (InterPro:IPR015798); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Copper amine oxidase family protein (TAIR:AT3G43670.1); Has 1558 Blast hits to 1554 proteins in 277 species: Archae - 14; Bacteria - 381; Metazoa - 247; Fungi - 454; Plants - 245; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 217 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23258253..23261772 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 80142.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 712 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEPSFARLF LLFFSFLLIF ATYSWVFGPD SGFLFGTRVR KTLGSNRQVH VDHSLEKPHH PLDPLTVREI NRVRTILSNH DPGFGSGSAT IHSMALDEPE 101: KSRVVQWKKG NKLLSRRAAV VAYWGGQTHE ITVDLDSGRV VSDVINRTSG YPILTLNDVF AASQVPLKSL EFNRSIEARG VKFSDLACIT PFAGWFGSEE 201: EGRRVIRVQC FTLQGTTNYF MRPLEGLYVT VDLDKLEVIK IIDKGPIPIP KASGTEYRFG VQNKPVHMDR INPISMEQPD GPSFRVEDGH LVKWANWVFH 301: VKADQRAGMI ISQATVRDSE TGEPRSVMYK GFPSELFVPY MDPEEGWYYK GYMDAGELGL GPTAMPLVPL NDCPRNSYYI DGVFASPDGK PIVQPNMICL 401: FERYAGDISW RHSEILFANA DIRESRPKVT LVARMATSVG NYDYIFDWEF QTDGLIRVTV AASGMLMVKG TPYDNVDDLG DREDDAGPLI SENVIGVVHD 501: HFITFHLDMD IDGPMNNSLV KVHLEKQRVP TGKSPRKSYL KVKKYIAKTE KDAQIKLSLY DPYEFHIVNP NRKSRVGNPA GYRIVPGGNA ASLLDHDDPP 601: QIRGAFTNNQ IWVTPYNRSE QYAGGVLIYQ SQGDDTLQVW SDRDRSIENK DIVLWYTLGF HHVPCQEDYP VMPTVAASFE LKPANFFESN PILGSAPFFE 701: KDLPVCRPFA SS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)