AT1G50170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sirohydrochlorin ferrochelatase B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes sirohydrochlorin ferrochelatase catalyzing the last step of the siroheme biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sirohydrochlorin ferrochelatase B (SIRB); FUNCTIONS IN: sirohydrochlorin ferrochelatase activity; INVOLVED IN: response to oxidative stress, siroheme biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX (InterPro:IPR002762); Has 1927 Blast hits to 1707 proteins in 620 species: Archae - 186; Bacteria - 1447; Metazoa - 1; Fungi - 0; Plants - 45; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 248 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:18582087..18583514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24926.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 225 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTTQSQFLVN LSYGGLASQS NLRANNRVSP SSCQITRTNR SWALPVSFKV EKFQLQRGRR RRGSPCFGES EGLVKNGIGD ADGIIIVDHG SRRRESNLML 101: EEFVKMFKEK TGYPIVEPAH MELAEPSIKD AFSLCVQQGA KRVVVSPFFL FPGRHWHTDI PSLTADAAKE FSGISYLITA PLGPHNLLLD VVNDRIQHCL 201: SHVEGDADEC LVCAGTNKCK LYNSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)