AT1G45332.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
onion epidermal cell layer (mitochondrial marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Translation elongation factor EFG/EF2 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Translation elongation factor EFG/EF2 protein; FUNCTIONS IN: translation factor activity, nucleic acid binding, translation elongation factor activity, ATP binding; INVOLVED IN: translational elongation; LOCATED IN: mitochondrion; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein synthesis factor, GTP-binding (InterPro:IPR000795), Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV (InterPro:IPR005517), Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), Translation elongation factor EFTu/EF1A, domain 2 (InterPro:IPR004161), Translation elongation factor EFG/EF2, C-terminal (InterPro:IPR000640), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), Translation elongation factor EFG/EF2 (InterPro:IPR004540), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup (InterPro:IPR014721), Elongation factor G/III/V (InterPro:IPR009022), Translation elongation/initiation factor/Ribosomal, beta-barrel (InterPro:IPR009000); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Translation elongation factor EFG/EF2 protein (TAIR:AT2G45030.1); Has 85600 Blast hits to 73226 proteins in 9903 species: Archae - 926; Bacteria - 48433; Metazoa - 8034; Fungi - 6838; Plants - 1636; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 19730 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:17172507..17176683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 83183.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 754 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARFPTSPAP NRLLRLFSSN KRSSSPTAAL LTGDFQLIRH FSAGTAARVA KDEKEPWWKE SMDKLRNIGI SAHIDSGKTT LTERVLFYTG RIHEIHEVRG 101: RDGVGAKMDS MDLEREKGIT IQSAATYCTW KDYKVNIIDT PGHVDFTIEV ERALRVLDGA ILVLCSVGGV QSQSITVDRQ MRRYEVPRVA FINKLDRMGA 201: DPWKVLNQAR AKLRHHSAAV QVPIGLEENF QGLIDLIHVK AYFFHGSSGE NVVAGDIPAD MEGLVAEKRR ELIETVSEVD DVLAEKFLND EPVSASELEE 301: AIRRATIAQT FVPVFMGSAF KNKGVQPLLD GVVSFLPSPN EVNNYALDQN NNEERVTLTG SPDGPLVALA FKLEEGRFGQ LTYLRVYEGV IKKGDFIINV 401: NTGKRIKVPR LVRMHSNDME DIQEAHAGQI VAVFGIECAS GDTFTDGSVK YTMTSMNVPE PVMSLAVQPV SKDSGGQFSK ALNRFQKEDP TFRVGLDPES 501: GQTIISGMGE LHLDIYVERM RREYKVDATV GKPRVNFRET ITQRAEFDYL HKKQSGGAGQ YGRVTGYVEP LPPGSKEKFE FENMIVGQAI PSGFIPAIEK 601: GFKEAANSGS LIGHPVENLR IVLTDGASHA VDSSELAFKM AAIYAFRLCY TAARPVILEP VMLVELKVPT EFQGTVAGDI NKRKGIIVGN DQEGDDSVIT 701: ANVPLNNMFG YSTSLRSMTQ GKGEFTMEYK EHSAVSNEVQ AQLVNAYSAS KATE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)