AT1G23360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a 2-phytyl-1,4-naphthoquinone methyltransferase that catalyzes the final step in phylloquinone (vitamin K1) biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MENG; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UbiE/COQ5 methyltransferase (InterPro:IPR004033); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT5G57300.3); Has 15509 Blast hits to 15504 proteins in 2608 species: Archae - 581; Bacteria - 10386; Metazoa - 311; Fungi - 448; Plants - 417; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3366 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8295421..8296893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29053.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 261 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAALLGIVSP VTFTGKHPVN SRSRRRTVVK CSNERRILFN RIAPVYDNLN DLLSLGQHRI WKNMAVSWSG AKKGDYVLDL CCGSGDLAFL LSEKVGSTGK 101: VMGLDFSSEQ LAVAATRQSL KARSCYKCIE WIEGDAIDLP FDDCEFDAVT MGYGLRNVVD RLRAMKEMYR VLKPGSRVSI LDFNKSNQSV TTFMQGWMID 201: NVVVPVATVY DLAKEYEYLK YSINGYLTGE ELETLALEAG FSSACHYEIS GGFMGNLVAM R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)